孙成

作者: | 来源: | 发布日期:2023-03-17 | 阅读次数:

高分辨率(1).jpg孙成,研究员、博士生导师

永利yl8886官方网站

地址:北京市海淀区西三环北路105

Emailcheng.sun@cnu.edu.cn

ORCID: https://orcid.org/0000-0001-7476-9224

ResearchGate: https://www.researchgate.net/profile/Cheng-Sun-15


主要研究方向

本实验室主要以蜜蜂科熊蜂属的昆虫为研究对象,采用基因组学、生物信息学、以及分子生物学方法

1、研究基因组演化、表型多样化以及物种分化的分子机制,尤其是转座子等重复序列在这些过程中的作用。

2、探究熊蜂社会分工行为的演化,尤其是社会性寄生行为产生的遗传基础。

3、挖掘熊蜂中与环境适应性相关的基因采用保护基因组学方法监测熊蜂的种群动态鉴定出威胁熊蜂种群的环境因子,进而制定相应的保护措施。

4、挖掘与熊蜂繁育、耐逆、授粉性能相关的基因,并利用这些基因培育具有优良品质的国产蜂种,促进农业生产。

5、完成上述研究内容所需的生物信息学工具开发与流程搭建。


研究生招生专业研究方向(博士)

0710J7(学术学位)生物信息学

01(全日制)不区分研究方向

071300(学术学位)生态学

02(全日制)生态基因组学

研究生招生专业及研究方向硕士

071002(学术学位)动物学

06(全日制)进化与功能基因组学

0710J7(学术学位)生物信息学

01(全日制)不区分研究方向

071300(学术学位)生态学

04(全日制)生态基因组学


主要工作、学习经历

2022.9至今 我校 研究员

2015.102022.8 中国农业科学院蜜蜂研究所 研究员

2011.32015.8 美国Colorado State University 博士后

2009.22010.12 美国University of Texas at Arlington 博士后

2004.92009.1 中国科学院遗传与发育生物学研究所 博士研究生


主持的课题

国家自然科学基金面上项目, 熊蜂社会性寄生行为产生的分子机制, 2023.1-2026.12

国家自然科学基金面上项目, 基于群体基因组与转录组数据研究串联重复序列对熊蜂环境适应性的影响, 2020.1-2023.12


代表性通讯/第一作者论文(*通讯作者#第一作者

  1. Li Y, Yao J, Sang H, Wang Q, Su L, Zhao X, Xia Z, Wang F, Wang K, Lou D, Wang G, Waterhouse RM, Wang H, Luo S, Sun C*. 2023. Pan-genome analysis highlights the role of structural variation in the evolution and environmental adaptation of Asian honeybees. Molecular Ecology Resources. doi: 10.1111/1755-0998.13905.

  2. Namasivayam S#, Sun C#, Bah AB, Oberstaller J, Pierre-Louis E, Etheridge RD, Feschotte C, Pritham EJ, Kissinger JC. 2023. Massive invasion of organellar DNA drives nuclear genome evolution in Toxoplasma. Proc Natl Acad Sci USA. 120(45):e2308569120.

  3. Sun C*, Zhang A, Chen J, Schaack S. 2023. 'Junk' that matters: the role of transposable elements in bumblebee genome evolution. Current Opinion in Insect Science. 59:101103.

  4. Cao L, Dai Z, Tan H, Zheng H, Wang Y, Chen J, Kuang H, Chong RA, Han M, Hu F, Sun W, Sun C*, Zhang Z*. 2023. Population Structure, Demographic History, and Adaptation of Giant Honeybees in China Revealed by Population Genomic Data. Genome Biology and Evolution. 15(3):evad025.

  5. Cao L, Zhao X, Chen Y, Sun C*. 2021. Chromosome-scale genome assembly of the high royal jelly-producing honeybees. Scientific Data. 8: 302.

该研究成果被评为“2021浙江科技大事件

  1. Ding L, Sang H, Sun C*. 2021. Genus-wide characterization of nuclear mitochondrial DNAs in bumblebee (Hymenoptera: Apidae) genomes. Insects. 12(11):963.

  2. Sun C*, Huang J, Wang Y, Zhao X, Su L, Thomas GWC, Zhao M et al. 2021. Genus-wide characterization of bumblebee genomes provides insights into their evolution and variation in ecological and behavioral traits. Molecular Biology and Evolution. 38(2):486-501.

Highlighted by Nature Reviews Genetics (doi:10.1038/s41576-020-00294-9)

  1. Zhao X, Su L, Xu W, Schaack S, Sun C*. 2020. Genome-wide identification of accessible chromatin regions in bumblebee by ATAC-seq. Scientific Data. 7: 367.

  2. Zhao X, Su L, Schaack S, Sadd BM, Sun C*. 2018. Tandem repeats contribute to coding sequence variation in bumblebees (Hymenoptera: Apidae). Genome Biology and Evolution. 10(12):3176–3187.

  3. Sun C, Feschotte C, Wu Z, Mueller RL. 2015. DNA transposons have colonized the genome of the giant virus Pandoravirus salinus. BMC Biology. 13(1): 38.

  4. Sun C, Mueller RL. 2014. Hellbender genome sequences shed light on genomic expansion at the base of crown salamanders. Genome Biology and Evolution. 6(7): 1818-1829.

  5. Sun C, Wyngaard G, Walton DB, Wichman HA, Mueller RL. 2014. Billions of basepairs of recently expanded, repetitive sequences are eliminated from the somatic genome during copepod development. BMC Genomics. 15(1): 186.

  6. Sun C, López Arriaza JR, Mueller RL. 2012. Slow DNA loss in the gigantic genomes of salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(12): 1340-1348.

Recommended by F1000http://f1000.com/prime/718020336)

  1. Sun C, Shepard DB, Chong RA, López Arriaza J, Hall K, Castoe TA, Feschotte C, Pollock DD, Mueller RL. 2012. LTR retrotransposons contribute to genomic gigantism in plethodontid salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(2): 168–183.


发明专利

1、商业地熊蜂与野生地熊蜂的差异INDEL及其分子标记与应用

2、一个商业地熊蜂与野生地熊蜂的差异基因及其分子标记与应用


社会兼职

中国昆虫学会青年工作委员会委员

第三次全国畜禽遗传资源普查技术专家组成员

中国科学、Molecular Ecology, Genome Biology and Evolution等杂志审稿人